Der Geschäftsführerausschuss setzt sich aus Geschäftsführern oder Präsidenten von 15 Branchenverbänden und fünf kantonalen Industrie- und Handelskammern zusammen und wird vom Vorsitzenden der Geschäftsleitung economiesuisse präsidiert. Der Geschäftsführerausschuss ist ein beratendes Organ für den Vorstand und den Vorstandsausschuss.